Les habitats ouverts de la trame jaune découlent d'une exploitation extensive traditionnelle ou se trouvent au-dessus de la limite des arbres. La composition en espèces et la hauteur de croissance des prairies et des pâturages varient en fonction de l'intensité d'utilisation. Plus le site est pauvre en nutriments, plus il est riche en espèces. Une fauche ou un pâturage extensifs contribuent à préserver cette richesse. Les associations herbacées des zones rudérales s'installent sur des sites dépourvus de végétation tels que les bords de chemins. Les ourlets, également dominés par les plantes herbacées, constituent des transitions entre les milieux ouverts et les haies ou lisières de forêt.

Tous les habitats de la trame bleu foncé sont marqués par l’eau, du moins temporairement. Les biocénoses des plans d’eau dépendent de leur taille et de leur profondeur. Les hauts-marais intacts sont constamment humides ; les sphaignes qui les composent ne sont pas décomposées et se déposent sous forme de matière organique. Les roselières et les cariçaies se trouvent également dans des sites marécageux permanents. Elles sont dominées par des végétaux herbacés, sont extrêmement productives et ont parfois des hauteurs de croissance extraordinaires. Les bas-marais dominés par les laiches se forment naturellement sur les sites humides et pauvres en nutriments. Les prairies humides sont dominées par les graminées et tributaires d’une exploitation extensive, comme le pâturage ou la fauche. Sans exploitation, la forêt peut s’installer sur ces sites à humidité variable. 

Écosystèmes à longue durée de vie, les forêts sont naturellement constituées d’une mosaïque de stades de développement les plus divers, un cycle durant 400 à 800 ans en moyenne, de la phase de croissance à la phase de décomposition. Le type d’association forestière qui se développe est déterminé par le sol, le climat local, l’altitude et l’exposition. La strate herbacée du sous-bois dépend également de la station et développe différentes caractéristiques en fonction de la densité du feuillage des arbres au cours de la période de végétation.

Une nuit naturellement sombre est importante pour l’alimentation et le cycle de vie de nombreuses espèces animales, mais aussi pour les plantes. Environ 30 % de tous les vertébrés et plus de 60 % de tous les invertébrés sont nocturnes et ont besoin de l’obscurité pour leurs activités. L’éclairage toujours plus excessif fragmente l’habitat de certains animaux nocturnes, perturbe leur orientation et réduit leur rayon d’action ainsi que l’offre en nourriture. Pour de nombreuses espèces, la lumière artificielle a en outre un effet perturbateur sur le développement, même sous l’eau. Il est donc nécessaire de délimiter de grands espaces et des corridors exempts de lumière, surtout le long des habitats semi-naturels et en particulier le long des boisements, des ruisseaux et des rivières.